Jan wordt op 19 november 1918 geboren in Schoonhoven als zoon van Hendrikus van der Wouden en Teuntje van der Wal. Zijn vader is varensgezel op een van de raderstoomboten van de Reederij op de Lek.
Jan is dienstplichtig grenadier in het Nederlandse leger. Hij wordt ingelijfd bij het Korps Motor Diens van de Staf 3e Bataljon van het Regiment Grenadiers.
Hij sneuvelde op 10 mei 1940 bij de verdediging van het vliegveld Ypenburg tegen de aanval van de Duitsers. Hij was chauffeur en vond de dood toen hij een auto met munitie naar de Nederlandse stellingen bracht. Hij werd getroffen door een schot in de rechterbors nabij de Molentocht in de buurt van de Johannahoeve. Tussen Ypenburg en Voorburg aan zijn bekomen krijgsverwondingen overleden. Voor zijn moed kreeg hij postuum het Bronzen Kruis en het oorlogsherinneringskruis met de gesp Nederland mei 1940. Hij werd begraven op begraafplaats Roodelaan 34 te Voorburg.
Jan van der Wouden is samen met nog achtentwintig kameraden begraven op de Oosterbegraafplaats in Voorburg, waar op het monument aldaar de namen van vier grenadiers worden genoemd, waaronder die van Jan van der Wouden en reserve 1e luitenant Abraham Leutscher.